Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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