Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF428Q96B54 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms