Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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GTF3C6Q969F1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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GTF3C6Q969F1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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