Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-CQ95604 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms