Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms