Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms