Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC107Q8WV48 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms