Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEDD1Q8NHV4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms