Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMIEQ8NEW7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms