Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms