Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC112Q8NEF3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms