Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 3625.5 ms