Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC191Q8NCU4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms