Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms