Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTU1Q7Z7A3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms