Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms