Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT27Q7Z3Y8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms