Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C12orf54Q6X4T0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C12orf54Q6X4T0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms