Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBR1LQ6UX01 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms