Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms