Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED9Q6R2W3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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