Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6P435 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6P435 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6P435 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6P435 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6P435 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6P435 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6P435 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6P435 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6P435 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6P435 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6P435 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6P435 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6P435 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6P435 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6P435 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6P435 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6P435 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6P435 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6P435 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms