Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms