Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms