Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms