Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms