Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms