Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms