Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms