Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms