Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms