Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF8Q3BBV2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms