Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB5Q2M3G0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB5Q2M3G0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB5Q2M3G0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB5Q2M3G0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB5Q2M3G0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB5Q2M3G0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB5Q2M3G0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms