Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms