Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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CDO1Q16878 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CDO1Q16878 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
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CDO1Q16878 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CDO1Q16878 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CDO1Q16878 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CDO1Q16878 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CDO1Q16878 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDO1Q16878 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CDO1Q16878 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CDO1Q16878 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CDO1Q16878 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CDO1Q16878 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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CDO1Q16878 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms