Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms