Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms