Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA6Q16445 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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