Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms