Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNHIT3Q15649 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms