Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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SKIV2LQ15477 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SKIV2LQ15477 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SKIV2LQ15477 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SKIV2LQ15477 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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