Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms