Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF4Q15306 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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