Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms