Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDGFRLQ15198 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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