Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDK1Q15118 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms