Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAM2Q15035 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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