Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD4Q14CM0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD4Q14CM0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms