Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME4Q14997 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME4Q14997 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
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