Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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CHD4Q14839 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
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CHD4Q14839 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
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CHD4Q14839 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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CHD4Q14839 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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CHD4Q14839 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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CHD4Q14839 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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CHD4Q14839 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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CHD4Q14839 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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CHD4Q14839 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD4Q14839 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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